HÓA ĐƠN ĐẦU VÀO BỊ BỎ SÓT KÊ KHAI LẠI NHƯ THẾ NÀO? KÊ KHAI TẠI KỲ PHÁT HIỆN HAY QUAY LẠI KỲ GỐC?

Trong nghiệp vụ quản lý tài chính và kế toán, việc bỏ sót hóa đơn GTGT đầu vào là tình huống thường phát sinh tại các doanh nghiệp. Việc xác định đúng kỳ kê khai và áp dụng đúng quy định pháp luật giúp doanh nghiệp tối ưu số thuế được khấu trừ, đồng thời đảm bảo tính tuân thủ trong công tác thanh kiểm tra thuế.

Căn cứ quy định tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP và hướng dẫn tại Thông tư 89/2026/TT-BTC, dưới đây là phân tích chi tiết từ góc nhìn kiểm toán nhằm giải đáp thắc mắc về phương án kê khai lại đối với hóa đơn bị bỏ sót

1. Kê Khai Tại Kỳ Phát Hiện Hay Quay Lại Kỳ Gốc?

Căn cứ Khoản 6 Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, việc xử lý sai sót đối với thuế GTGT đầu vào được xác định dựa trên bản chất ảnh hưởng của sai sót đó đến nghĩa vụ thuế của doanh nghiệp:

• Trường hợp quay lại kỳ gốc: Áp dụng khi việc điều chỉnh làm phát sinh tăng số thuế GTGT phải nộp hoặc làm giảm số thuế GTGT đã được hoàn.

• Trường hợp kê khai tại kỳ phát hiện: Áp dụng khi việc điều chỉnh chỉ làm giảm số thuế GTGT phải nộp hoặc làm thay đổi (tăng/giảm) số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau

Đối với hóa đơn GTGT đầu vào hợp pháp, đủ điều kiện khấu trừ nhưng bị bỏ sót chưa kê khai, việc bổ sung hóa đơn này bản chất là làm tăng số thuế GTGT đầu vào được khấu trừ.

Việc đưa thêm hóa đơn bỏ sót vào kỳ phát sinh chỉ làm giảm số thuế GTGT phải nộp hoặc làm tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau tại kỳ đó. Do đó, câu trả lời là KHÔNG quay lại kỳ gốc để kê khai bổ sung, mà doanh nghiệp thực hiện kê khai tại kỳ phát hiện sai sót (kỳ hiện tại).

2. Hóa Đơn Đầu Vào Bị Bỏ Sót Được Kê Khai Lại Như Thế Nào?

Theo hướng dẫn lập Mẫu 01/GTGT ban hành kèm Thông tư 89/2026/TT-BTC, trình tự kê khai lại đối với hóa đơn đầu vào bị bỏ sót được thực hiện như sau:

• Kê khai trên Tờ khai thuế GTGT kỳ hiện tại: Doanh nghiệp phản ánh giá trị tiền thuế GTGT bị bỏ sót vào Chỉ tiêu  "Điều chỉnh tăng thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước" trên Tờ khai thuế GTGT của kỳ tính thuế phát hiện ra sai sót.

• Không lập Tờ khai bổ sung (KHBS): Doanh nghiệp không quay lại lập Tờ khai bổ sung cho kỳ tính thuế đã bỏ sót hóa đơn.

3. Ví Dụ Minh Họa Nghiệp Vụ

Tình huống: Tháng 07/2026, doanh nghiệp phát sinh hóa đơn GTGT đầu vào hợp pháp với tiền thuế GTGT là 5.000.000 VNĐ. Kế toán bỏ sót không đưa vào Tờ khai thuế GTGT tháng 07/2026 và đến kỳ kê khai tháng 09/2026 mới phát hiện.

Xử lý nghiệp vụ theo từng trường hợp cụ thể của kỳ gốc (Tháng 07/2026):

Kỳ gốc phát sinh thuế GTGT phải nộp: Giả sử Tờ khai tháng 07/2026 thể hiện số thuế phải nộp là 20.000.000 VNĐ. Nếu ghi nhận thêm hóa đơn bị bỏ sót, số thuế phải nộp của tháng 07/2026 giảm xuống còn 15.000.000 VNĐ (làm giảm nghĩa vụ thuế phải nộp).

• Phương án xử lý: Doanh nghiệp không quay lại sửa Tờ khai tháng 07/2026, thực hiện kê khai 5.000.000 VNĐ vào Chỉ tiêu [38] trên Tờ khai thuế GTGT tháng 09/2026.

Kỳ gốc còn thuế GTGT được khấu trừ: Giả sử Tờ khai tháng 07/2026 thể hiện số thuế còn được khấu trừ chuyển kỳ sau là 10.000.000 VNĐ. Nếu ghi nhận thêm hóa đơn bị bỏ sót, số thuế được khấu trừ tăng lên 15.000.000 VNĐ (làm tăng số thuế còn được khấu trừ).

• Phương án xử lý: Doanh nghiệp không quay lại sửa Tờ khai tháng 07/2026, thực hiện kê khai 5.000.000 VNĐ vào Chỉ tiêu trên Tờ khai thuế GTGT tháng 09/2026.

4. Các Điều Kiện Pháp Lý Cần Lưu Ý Khi Kê Khai Lại

Để việc kê khai hóa đơn bỏ sót tại kỳ phát hiện đảm bảo tính hợp lệ, doanh nghiệp cần lưu ý các điều kiện bắt buộc sau:

1. Thời điểm thực hiện: Việc kê khai lại phải được hoàn thành trước khi cơ quan thuế hoặc cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra, thanh tra thuế tại trụ sở người nộp thuế.

2. Điều kiện khấu trừ: Hóa đơn bị bỏ sót phải đáp ứng đầy đủ điều kiện khấu trừ thuế GTGT theo quy định (hóa đơn hợp pháp, có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hóa đơn từ mức quy định trở lên, phục vụ hoạt động sản xuất kinh doanh chịu thuế GTGT,...).

3. Phân biệt bản chất sai sót: Quy định kê khai tại kỳ phát hiện (Chỉ tiêu [38]) chỉ áp dụng cho trường hợp bỏ sót hóa đơn đầu vào (chưa kê khai). Trường hợp trước đây doanh nghiệp đã kê khai sai dẫn đến tính thừa số thuế được khấu trừ hoặc thiếu số thuế phải nộp thì bắt buộc phải quay lại kỳ gốc lập Tờ khai bổ sung để điều chỉnh.

Doanh nghiệp của bạn đang gặp vướng mắc khi rà soát dữ liệu hóa đơn điện tử hoặc cần hỗ trợ kê khai điều chỉnh, soát xét rủi ro thuế trước kỳ quyết toán?

Hãy liên hệ trực tiếp với đội ngũ chuyên gia kiểm toán của chúng tôi ngay hôm nay để nhận giải pháp tư vấn toàn diện, bảo vệ dòng tiền doanh nghiệp an toàn và đúng pháp luật!

THÔNG TIN LIÊN HỆ

CÔNG TY TNHH KIỂM TOÁN VÀ TƯ VẤN CHUẨN VIỆT (VIETVALUES)

Địa chỉ: 33 Phan Văn Khỏe, Phường Chợ Lớn, TP.HCM

Hotline: 0919 696 168

Website: www.vietvalues.com

Email: admin@vietvalues.com

Zalo OA: https://zalo.me/1205575301328198469